Många betydelsefulla virussjukdomar och några bakterieorsakade sjukdomar kan i dag förebyggas med hjälp av vacciner. Vaccin finns även mot parasitsjukdomen koccidios.
Efter vaccination av fjäderfä kan i vissa fall biverkningar förekomma. Kända biverkningar finns nämnda i bipacksedeln för respektive vaccin. Det är viktigt att veterinär informeras om misstänkta biverkningar eftersom dessa ska rapporteras. Det är också viktigt att informera om bristande effekt av vaccin. Som djurägare är det också möjligt att själv rapportera misstänkta biverkningar till Läkemedelsverket.